植物作为生命体，其结构层次是一个复杂而有序的体系。从微观到宏观，植物的构成可以分为多个层级，这些层级帮助我们更好地理解植物的生长发育和功能实现。然而，在这些层级中，并非所有生物学上的分类都适用于植物。那么，植物的结构层次究竟有哪些？又有哪些选项是不包含在内的呢？

首先，让我们明确植物的基本构成单位——细胞。细胞是所有生物体的基础单元，植物也不例外。每一个植物体都是由无数个细胞组成的，这些细胞通过特定的方式排列组合，形成了植物复杂的结构。

其次，细胞进一步组合成为组织。植物组织是由形态相似、功能相近的细胞组成的群体，例如分生组织负责植物的生长，而营养组织则承担着储存养分的任务。不同类型的组织协同工作，为植物的生存提供了保障。

再往上一层，则是器官的概念。植物的器官是指由多种组织构成的具有一定功能的整体，比如根、茎、叶等。它们各自承担不同的生理功能，共同维持植物的生命活动。

然而，当我们提到“系”时，这一概念并不属于植物的结构层次范畴。在动物学中，“系”是用来描述动物体内功能相关的器官集合，比如循环系统、呼吸系统等。但植物没有这种系统的划分方式，因为它们的生理过程更加分散且独立。

综上所述，植物的结构层次主要包括细胞、组织和器官，而不包括“系”。因此，正确答案是D. 系。通过对植物结构层次的理解，我们可以更深入地认识自然界的奇妙与多样性，同时也能激发对生命科学的兴趣与探索热情。